DEKRA allie une structure associative stratégique à un groupe d'entreprises opérationnel. À la tête de l'organisation faîtière se trouve DEKRA e.V., dont l'instance de contrôle suprême est le Conseil présidentiel, présidé par Stefan Kölbl.
DEKRA e.V. détient 100 % des actions de DEKRA SE, qui, en tant que holding opérationnelle, gère les activités mondiales (services d'essais, d'inspection et de certification). Le directoire de DEKRA SE gère les opérations quotidiennes et définit l'orientation stratégique des filiales et des divisions régionales de la société à l'échelle mondiale.